phpMaLogithèque est destinée à créer une sélection de logiciels, visualisable via une interface Web, entièrement gérée par un module d'administration sécurisé par mot de passe. Ce dernier vous permet notamment d'ajouter, de retirer des logiciels de votre logithèque. Dans l'espace visiteurs, partie visible de l'application, les logiciels peuvent être triés par nom ou par date d'ajout. Le visiteur peut lire pour chaque logiciel une petite fiche descriptive, montrant notamment la version du logiciel, sa date de sortie, la taille du fichier à télécharger. Depuis la version 2, les logiciels sont classés par catégories, et la recherche peut s'effectuer au sein d'une catégorie sélectionnée ou sur l'ensemble de la logithèque. Pour chaque logiciel, le visiteur peut par ailleurs déposer un commentaire, ou visualiser les commentaires précédemment déposés par les autres visiteurs.